Link type | Probability | Chain B piercings | Chain E piercings | Chain L piercings | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L | |||||||||||
view details | Unlink | 85% | +54L -234L |
Chain B Sequence |
AYDRAITVFSPDGRLFQVEYAREAVKKGSTALGMKFANGVLLISDKKVRSRLIEQNSIEKIQLIDDYVAAVTSGLVADARVLVDFARISAQQEKVTYGSLVNIENLVKRVADQMQQYTQYGGVRPYGVSLIFAGIDQIGPRLFDCDPAGTINEYKATAIGSGKDAVVSFLEREYKENLPEKEAVTLGIKALKSSLEEGEELKAPEIASITVGNKYRIYDQEEVKKFL |
Chain B Sequence |
AYDRAITVFSPDGRLFQVEYAREAVKKGSTALGMKFANGVLLISDKKVRSRLIEQNSIEKIQLIDDYVAAVTSGLVADARVLVDFARISAQQEKVTYGSLVNIENLVKRVADQMQQYTQYGGVRPYGVSLIFAGIDQIGPRLFDCDPAGTINEYKATAIGSGKDAVVSFLEREYKENLPEKEAVTLGIKALKSSLEEGEELKAPEIASITVGNKYRIYDQEEVKKFL |
Chain B Sequence |
TTTVGITLKDAVIMATERRVTMENFIMHKNGKKLFQIDTYTGMTIAGLVGDAQVLVRYMKAELELYRLQRRVNMPIEAVATLLSNMLNQVKYMPYMVQLLVGGIDTAPHVFSIDAAGGSVEDIYASTGSGSPFVYGVLESQYSEKMTVDEGVDLVIRAISAAKQRDSASGGMIDVAVITRKDGYVQLPTDQIESRIRKLGLIL |
sequence length | 227,227,203 |
structure length | 227,227,203 |
publication title |
Structural Models for Interactions between the 20S proteasome and its PAN/19S activators.
pubmed doi rcsb |
molecule tags | Hydrolase/hydrolase activator |
molecule keywords | Proteasome subunit alpha |
source organism | Thermoplasma acidophilum |
ec nomenclature |
ec 3.4.25.1: Proteasome endopeptidase complex. ec 3.4.25.1: Proteasome endopeptidase complex. ec 3.4.25.1: Proteasome endopeptidase complex. |
pdb deposition date | 2009-09-12 |
LinkProt deposition date | 2016-08-17 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
BEL | PF00227 | Proteasome | Proteasome subunit |
BEL | PF10584 | Proteasome_A_N | Proteasome subunit A N-terminal signature |
BEL | PF00227 | Proteasome | Proteasome subunit |
BEL | PF10584 | Proteasome_A_N | Proteasome subunit A N-terminal signature |
BEL | PF00227 | Proteasome | Proteasome subunit |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | 4-Layer Sandwich | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 | ||
Alpha Beta | 4-Layer Sandwich | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 | ||
Alpha Beta | 4-Layer Sandwich | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 | Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1 |
#chains in the LinkProt database with same CATH superfamily 3JTL FGP; 3JTL FRU; 3JSE FNP; 3JSE ABR; 3JTL AFU; 3JTL DEL; 3JSE BST; 3JSE DJT; 3JTL AQU; 3JTL BEK; 3JTL FIO; 3JSE CDS; 3JSE COS; 3JSE CST; 3JTL BPR; 3JSE EU; 3JSE FO; 3JTL DOP; 3JTL FPT; 3JTL EO; 3JTL CS; 3JTL FG; 3JTL ESU; 3JTL ACH; 3JSE BPR; 3JTL BET; 3JTL DNP; 3JTL FP; 3JTL AG; 3JSE ABQ; 3JSE BRS; 3JSE EPS; 3JSE CQS; 3JSE BS; 3JTL BDL; 3JSE AFO; 3JSE DTU; 3JTL BHL; 3JTL CHP; 3JTL BMS; 3JTL CDH; 3JTL BDI; 3JTL EQT; 3JTL BPS; 3JSE ACQ; 3JSE EGP; 3JTL DPT; 3JTL NPS; 3JTL FGI; 3JTL CT; 3JTL BCF; 3JTL FO; 3JTL HIL; 3JTL APQ; 3JTL ACG; 3JTL ETU; 3JTL EU; 3JTL EFK; 3JSE BDR; 3JSE AEQ; 3JSE GPS; 3JTL EHL; 3JTL EGJ; 3JTL EFT; 3JTL AMR; 3JTL DGO; 3JTL BFT; 3JSE DFT; 3JSE FJO; 3JTL CDG; 3JTL DHQ; 3JTL BPT; 3JTL FHK; 3JSE CES; 3JSE FQR; 3JTL DFO; 3JTL ACJ; 3JTL APT; 3JTL DEH; 3JTL CD; 3JSE IPU; 3JTL GKO; 3JSE EFP; 3JTL CQR; 3JTL GRU; 3JSE GRS; 3JTL FQU; 3JSE GO; 3JTL CEL; 3JTL GOP; 3JTL GIP; 3JTL AOU; 3JTL ATU; 3JTL DPR; 3JTL ADG; 3JSE AHQ; 3JSE FNQ; 3JSE GOP; 3JTL CJR; 3JTL DEO; 3JTL AFG; 3JSE BEU; 3JTL EFM; 3JTL BEJ; 3JTL GNT; 3JSE BFR; 3JTL EGP; 3JTL AFJ; 3JSE CSU; 3JTL CGN; 3JTL CIQ; 3JTL AGK; 3JSE DIT; 3JTL CEI; 3JTL AP; 3JTL AQ; 3JSE ADQ; 3JTL BHN; 3JSE GHQ; 3JTL DNQ; 3JSE AQ; 3JTL CFP; 3JSE GST; 3JSE FPU; 3JSE BCT; 3JSE CGS; 3JSE DET; 3JTL GP; 3JSE EOU; 3JTL EFP; 3JTL BEM; 3JSE EO; 3JTL BSU; 3JSE BQR; 3JTL GRS; 3JSE FP; 3JTL CDK; 3JTL BS; 3JTL CHL; 3JSE DE; 3JTL GLP; 3JTL AJO; 3JSE FGN; 3JTL MQU; 3JTL BPQ; 3JTL ADH; 3JSE BR; 3JTL BCJ; 3JSE LPR; 3JSE FNO; 3JSE FPR; 3JTL DEQ; 3JSE GPR; 3JSE BQ; 3JSE EP; 3JTL DU; 3JSE ETU; 3JSE ENR; 3JSE BCR; 3JTL BPU; 3JSE ACS; 3JTL EFN; 3JTL FHL; 3JSE DU; 3JTL ADK; 3JTL ABG; 3JTL AHK; 3JTL FMP; 3JSE BDT; 3JSE DQT; 3JSE AGP; 3JSE FU; 3JTL DET; 3JSE EF; 3JSE GPQ; 3JSE AQR; 3JTL KPR; 3JTL FQT; 3JTL GQ; 3JTL CEM; 3JTL ALO; 3JTL DQR; 3JSE DEU; 3JSE CS; 3JSE FG; 3JSE CT; 3JTL ABI; 3JSE FGH; 3JSE ABC; 3JSE FQT; 3JSE AG; 3JTL CFT; 3JSE BRT; 3JTL DEN; 3JSE GP; 3JSE EOQ; 3JTL CPQ; 3JTL GPS; 3JTL BOR; 3JSE CDU; 3JTL AB; 3JTL ASU; 3JSE AQS; 3JTL FNP; 3JSE ADT; 3JSE AB; 3JTL AR; 3JSE DRT; 3JTL GMQ; 3JTL EFO; 3JSE EPU; 3JTL AOR; 3JTL AEI; 3JTL DFJ; 3JTL COS; 3JSE AR; 3JTL EMP; 3JSE GIM; 3JTL CPT; 3JTL DSU; 3JTL BEL; 3JSE EFU; 3JTL DGJ; 3JTL CFI; 3JTL BGI; 3JTL CET; 3JTL CDJ; 3JTL CIS; 3JTL DQS; 3JTL CEK; 3JTL FPS; 3JSE CEU; 3JSE FHJ; 3JSE DFO; 3JSE APQ; 3JTL EST; 3JSE EGU; 3JSE CIS; 3JTL FLO; 3JTL FMT; 3JTL FQ; 3JSE BFO; 3JSE FPS; 3JTL AFT; 3JSE GPU; 3JTL BLS; 3JTL AET; 3JTL BDK; 3JTL GQU; 3JTL ANS; 3JTL DRU; 3JSE FMU; 3JTL CDI; 3JSE BGR; 3JTL FIP; 3JTL DOT; 3JTL GNR; 3JTL AGI; 3JSE DT; 3JSE FMO; 3JTL ADJ; 3JTL AKP; 3JTL FKN; 3JSE EQT; 3JTL DT; 3JTL DEJ; 3JSE FGO; 3JTL BCH; 3JSE GLP; 3JSE AGQ; 3JSE CFO; 3JSE DST; 3JSE CRS; 3JTL EPR; 3JTL BR; 3JTL BDH; 3JTL FQS; 3JSE CGP; 3JSE AFQ; 3JTL ABH; 3JSE ESU; 3JSE FQS; 3JSE BCS; 3JTL DFN; 3JTL AHM; 3JSE BRU; 3JTL FMR; 3JSE GQ; 3JTL FNO; 3JTL DLT; 3JSE DGP; 3JSE DOT; 3JSE AEU; 3JTL CFM; 3JSE CDT; 3JTL AOS; 3JTL EOU; 3JTL EQR; 3JTL FNQ; 3JSE EQS; 3JTL CEO; 3JSE EFO; 3JTL FGO; 3JSE BOR; 3JTL BC; #chains in the LinkProt database with same CATH topology 3JTL FGP; 3JTL FRU; 3JSE FNP; 3JSE ABR; 3JTL AFU; 3JTL DEL; 3JSE BST; 3JSE DJT; 3JTL AQU; 3JTL BEK; 3JTL FIO; 3JSE CDS; 3JSE COS; 3JSE CST; 3JTL BPR; 3JSE EU; 3JSE FO; 3JTL DOP; 3JTL FPT; 3JTL EO; 3JTL CS; 3JTL FG; 3JTL ESU; 3JTL ACH; 3JSE BPR; 3JTL BET; 3JTL DNP; 3JTL FP; 3JTL AG; 3JSE ABQ; 3JSE BRS; 3JSE EPS; 3JSE CQS; 3JSE BS; 3JTL BDL; 3JSE AFO; 3JSE DTU; 3JTL BHL; 3JTL CHP; 3JTL BMS; 3JTL CDH; 3JTL BDI; 3JTL EQT; 3JTL BPS; 3JSE ACQ; 3JSE EGP; 3JTL DPT; 3JTL NPS; 3JTL FGI; 3JTL CT; 3JTL BCF; 3JTL FO; 3JTL HIL; 3JTL APQ; 3JTL ACG; 3JTL ETU; 3JTL EU; 3JTL EFK; 3JSE BDR; 3JSE AEQ; 3JSE GPS; 3JTL EHL; 3JTL EGJ; 3JTL EFT; 3JTL AMR; 3JTL DGO; 3JTL BFT; 3JSE DFT; 3JSE FJO; 3JTL CDG; 3JTL DHQ; 3JTL BPT; 3JTL FHK; 3JSE CES; 3JSE FQR; 3JTL DFO; 3JTL ACJ; 3JTL APT; 3JTL DEH; 3JTL CD; 3JSE IPU; 3JTL GKO; 3JSE EFP; 3JTL CQR; 3JTL GRU; 3JSE GRS; 3JTL FQU; 3JSE GO; 3JTL CEL; 3JTL GOP; 3JTL GIP; 3JTL AOU; 3JTL ATU; 3JTL DPR; 3JTL ADG; 3JSE AHQ; 3JSE FNQ; 3JSE GOP; 3JTL CJR; 3JTL DEO; 3JTL AFG; 3JSE BEU; 3JTL EFM; 3JTL BEJ; 3JTL GNT; 3JSE BFR; 3JTL EGP; 3JTL AFJ; 3JSE CSU; 3JTL CGN; 3JTL CIQ; 3JTL AGK; 3JSE DIT; 3JTL CEI; 3JTL AP; 3JTL AQ; 3JSE ADQ; 3JTL BHN; 3JSE GHQ; 3JTL DNQ; 3JSE AQ; 3JTL CFP; 3JSE GST; 3JSE FPU; 3JSE BCT; 3JSE CGS; 3JSE DET; 3JTL GP; 3JSE EOU; 3JTL EFP; 3JTL BEM; 3JSE EO; 3JTL BSU; 3JSE BQR; 3JTL GRS; 3JSE FP; 3JTL CDK; 3JTL BS; 3JTL CHL; 3JSE DE; 3JTL GLP; 3JTL AJO; 3JSE FGN; 3JTL MQU; 3JTL BPQ; 3JTL ADH; 3JSE BR; 3JTL BCJ; 3JSE LPR; 3JSE FNO; 3JSE FPR; 3JTL DEQ; 3JSE GPR; 3JSE BQ; 3JSE EP; 3JTL DU; 3JSE ETU; 3JSE ENR; 3JSE BCR; 3JTL BPU; 3JSE ACS; 3JTL EFN; 3JTL FHL; 3JSE DU; 3JTL ADK; 3JTL ABG; 3JTL AHK; 3JTL FMP; 3JSE BDT; 3JSE DQT; 3JSE AGP; 3JSE FU; 3JTL DET; 3JSE EF; 3JSE GPQ; 3JSE AQR; 3JTL KPR; 3JTL FQT; 3JTL GQ; 3JTL CEM; 3JTL ALO; 3JTL DQR; 3JSE DEU; 3JSE CS; 3JSE FG; 3JSE CT; 3JTL ABI; 3JSE FGH; 3JSE ABC; 3JSE FQT; 3JSE AG; 3JTL CFT; 3JSE BRT; 3JTL DEN; 3JSE GP; 3JSE EOQ; 3JTL CPQ; 3JTL GPS; 3JTL BOR; 3JSE CDU; 3JTL AB; 3JTL ASU; 3JSE AQS; 3JTL FNP; 3JSE ADT; 3JSE AB; 3JTL AR; 3JSE DRT; 3JTL GMQ; 3JTL EFO; 3JSE EPU; 3JTL AOR; 3JTL AEI; 3JTL DFJ; 3JTL COS; 3JSE AR; 3JTL EMP; 3JSE GIM; 3JTL CPT; 3JTL DSU; 3JTL BEL; 3JSE EFU; 3JTL DGJ; 3JTL CFI; 3JTL BGI; 3JTL CET; 3JTL CDJ; 3JTL CIS; 3JTL DQS; 3JTL CEK; 3JTL FPS; 3JSE CEU; 3JSE FHJ; 3JSE DFO; 3JSE APQ; 3JTL EST; 3JSE EGU; 3JSE CIS; 3JTL FLO; 3JTL FMT; 3JTL FQ; 3JSE BFO; 3JSE FPS; 3JTL AFT; 3JSE GPU; 3JTL BLS; 3JTL AET; 3JTL BDK; 3JTL GQU; 3JTL ANS; 3JTL DRU; 3JSE FMU; 3JTL CDI; 3JSE BGR; 3JTL FIP; 3JTL DOT; 3JTL GNR; 3JTL AGI; 3JSE DT; 3JSE FMO; 3JTL ADJ; 3JTL AKP; 3JTL FKN; 3JSE EQT; 3JTL DT; 3JTL DEJ; 3JSE FGO; 3JTL BCH; 3JSE GLP; 3JSE AGQ; 3JSE CFO; 3JSE DST; 3JSE CRS; 3JTL EPR; 3JTL BR; 3JTL BDH; 3JTL FQS; 3JSE CGP; 3JSE AFQ; 3JTL ABH; 3JSE ESU; 3JSE FQS; 3JSE BCS; 3JTL DFN; 3JTL AHM; 3JSE BRU; 3JTL FMR; 3JSE GQ; 3JTL FNO; 3JTL DLT; 3JSE DGP; 3JSE DOT; 3JSE AEU; 3JTL CFM; 3JSE CDT; 3JTL AOS; 3JTL EOU; 3JTL EQR; 3JTL FNQ; 3JSE EQS; 3JTL CEO; 3JSE EFO; 3JTL FGO; 3JSE BOR; 3JTL BC; #chains in the LinkProt database with same CATH homology 3JTL FGP; 3JTL FRU; 3JSE FNP; 3JSE ABR; 3JTL AFU; 3JTL DEL; 3JSE BST; 3JSE DJT; 3JTL AQU; 3JTL BEK; 3JTL FIO; 3JSE CDS; 3JSE COS; 3JSE CST; 3JTL BPR; 3JSE EU; 3JSE FO; 3JTL DOP; 3JTL FPT; 3JTL EO; 3JTL CS; 3JTL FG; 3JTL ESU; 3JTL ACH; 3JSE BPR; 3JTL BET; 3JTL DNP; 3JTL FP; 3JTL AG; 3JSE ABQ; 3JSE BRS; 3JSE EPS; 3JSE CQS; 3JSE BS; 3JTL BDL; 3JSE AFO; 3JSE DTU; 3JTL BHL; 3JTL CHP; 3JTL BMS; 3JTL CDH; 3JTL BDI; 3JTL EQT; 3JTL BPS; 3JSE ACQ; 3JSE EGP; 3JTL DPT; 3JTL NPS; 3JTL FGI; 3JTL CT; 3JTL BCF; 3JTL FO; 3JTL HIL; 3JTL APQ; 3JTL ACG; 3JTL ETU; 3JTL EU; 3JTL EFK; 3JSE BDR; 3JSE AEQ; 3JSE GPS; 3JTL EHL; 3JTL EGJ; 3JTL EFT; 3JTL AMR; 3JTL DGO; 3JTL BFT; 3JSE DFT; 3JSE FJO; 3JTL CDG; 3JTL DHQ; 3JTL BPT; 3JTL FHK; 3JSE CES; 3JSE FQR; 3JTL DFO; 3JTL ACJ; 3JTL APT; 3JTL DEH; 3JTL CD; 3JSE IPU; 3JTL GKO; 3JSE EFP; 3JTL CQR; 3JTL GRU; 3JSE GRS; 3JTL FQU; 3JSE GO; 3JTL CEL; 3JTL GOP; 3JTL GIP; 3JTL AOU; 3JTL ATU; 3JTL DPR; 3JTL ADG; 3JSE AHQ; 3JSE FNQ; 3JSE GOP; 3JTL CJR; 3JTL DEO; 3JTL AFG; 3JSE BEU; 3JTL EFM; 3JTL BEJ; 3JTL GNT; 3JSE BFR; 3JTL EGP; 3JTL AFJ; 3JSE CSU; 3JTL CGN; 3JTL CIQ; 3JTL AGK; 3JSE DIT; 3JTL CEI; 3JTL AP; 3JTL AQ; 3JSE ADQ; 3JTL BHN; 3JSE GHQ; 3JTL DNQ; 3JSE AQ; 3JTL CFP; 3JSE GST; 3JSE FPU; 3JSE BCT; 3JSE CGS; 3JSE DET; 3JTL GP; 3JSE EOU; 3JTL EFP; 3JTL BEM; 3JSE EO; 3JTL BSU; 3JSE BQR; 3JTL GRS; 3JSE FP; 3JTL CDK; 3JTL BS; 3JTL CHL; 3JSE DE; 3JTL GLP; 3JTL AJO; 3JSE FGN; 3JTL MQU; 3JTL BPQ; 3JTL ADH; 3JSE BR; 3JTL BCJ; 3JSE LPR; 3JSE FNO; 3JSE FPR; 3JTL DEQ; 3JSE GPR; 3JSE BQ; 3JSE EP; 3JTL DU; 3JSE ETU; 3JSE ENR; 3JSE BCR; 3JTL BPU; 3JSE ACS; 3JTL EFN; 3JTL FHL; 3JSE DU; 3JTL ADK; 3JTL ABG; 3JTL AHK; 3JTL FMP; 3JSE BDT; 3JSE DQT; 3JSE AGP; 3JSE FU; 3JTL DET; 3JSE EF; 3JSE GPQ; 3JSE AQR; 3JTL KPR; 3JTL FQT; 3JTL GQ; 3JTL CEM; 3JTL ALO; 3JTL DQR; 3JSE DEU; 3JSE CS; 3JSE FG; 3JSE CT; 3JTL ABI; 3JSE FGH; 3JSE ABC; 3JSE FQT; 3JSE AG; 3JTL CFT; 3JSE BRT; 3JTL DEN; 3JSE GP; 3JSE EOQ; 3JTL CPQ; 3JTL GPS; 3JTL BOR; 3JSE CDU; 3JTL AB; 3JTL ASU; 3JSE AQS; 3JTL FNP; 3JSE ADT; 3JSE AB; 3JTL AR; 3JSE DRT; 3JTL GMQ; 3JTL EFO; 3JSE EPU; 3JTL AOR; 3JTL AEI; 3JTL DFJ; 3JTL COS; 3JSE AR; 3JTL EMP; 3JSE GIM; 3JTL CPT; 3JTL DSU; 3JTL BEL; 3JSE EFU; 3JTL DGJ; 3JTL CFI; 3JTL BGI; 3JTL CET; 3JTL CDJ; 3JTL CIS; 3JTL DQS; 3JTL CEK; 3JTL FPS; 3JSE CEU; 3JSE FHJ; 3JSE DFO; 3JSE APQ; 3JTL EST; 3JSE EGU; 3JSE CIS; 3JTL FLO; 3JTL FMT; 3JTL FQ; 3JSE BFO; 3JSE FPS; 3JTL AFT; 3JSE GPU; 3JTL BLS; 3JTL AET; 3JTL BDK; 3JTL GQU; 3JTL ANS; 3JTL DRU; 3JSE FMU; 3JTL CDI; 3JSE BGR; 3JTL FIP; 3JTL DOT; 3JTL GNR; 3JTL AGI; 3JSE DT; 3JSE FMO; 3JTL ADJ; 3JTL AKP; 3JTL FKN; 3JSE EQT; 3JTL DT; 3JTL DEJ; 3JSE FGO; 3JTL BCH; 3JSE GLP; 3JSE AGQ; 3JSE CFO; 3JSE DST; 3JSE CRS; 3JTL EPR; 3JTL BR; 3JTL BDH; 3JTL FQS; 3JSE CGP; 3JSE AFQ; 3JTL ABH; 3JSE ESU; 3JSE FQS; 3JSE BCS; 3JTL DFN; 3JTL AHM; 3JSE BRU; 3JTL FMR; 3JSE GQ; 3JTL FNO; 3JTL DLT; 3JSE DGP; 3JSE DOT; 3JSE AEU; 3JTL CFM; 3JSE CDT; 3JTL AOS; 3JTL EOU; 3JTL EQR; 3JTL FNQ; 3JSE EQS; 3JTL CEO; 3JSE EFO; 3JTL FGO; 3JSE BOR; 3JTL BC;
#similar chains in the LinkProt database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unlinked ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...