5GQCABCE

Crystal structure of lacto-n-biosidase lnbx from bifidobacterium longum subsp. longum, ligand-free form
Link type Probability Chain A piercings Chain B piercings Chain C piercings Chain E piercings
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
view details
Other Other 35% -625B -628C +628E +121A +628C +628C +628C -260E -297E -343E +356E -381E +399E -413E +441E +456E +480E +504E +532E +627E -628A -628A -598B -628B
Interpreting sequences
Chain A Sequence
GTTYYVSSAHGDDANAGTSENAPWKSLTKVNDIASDLGPGDSVLLEYGSEFNDQYLHIKDTAGNADAPITISAYGDADEGKPVIASNGVKGSQWEQDYRANVGNHKNKGTVSTTLLLKDVSYITVSNLEITNDDADVYDPIDTWKWTDTPDSDGTKLDRSASRMDRTGVAGIAENGATMSNVTLDNLYIHDVDGNIYNKHMANGGIYFMAHYPMENTSAETDVWLREHVSRFDHVTIRNSTVKDVDRWGIAVGYTAYLNYIDANYGDGSIDDALIAKYGSTNVRIENNYVKGAGGDAITLMYCDRPVIEHNVGDSVSKHINTQDYTQPGSYGGRVAAGIWPWRCKDPVFQYNEMYNNLNAEHGNGDGQAWDADYGDGTLYQYNYSYGNSFASLMICNWYAVNTTFRYNISQNDRQGVFDLPSNGPGNHIYNNTVYVDADSQVLTKRSNSQSLFENNIFINATNTKKTETWNRGSQNGGQTYDNNMYVNYANKPTSDANAIEADDVSAVLAGAGSAPTSALKSGAEHARTGEKAAFDGYRPVAGSKAINAGKVVSDLNDYAVENDFLGNAVKGRPDLGAVEAA
Chain A Sequence
GTTYYVSSAHGDDANAGTSENAPWKSLTKVNDIASDLGPGDSVLLEYGSEFNDQYLHIKDTAGNADAPITISAYGDADEGKPVIASNGVKGSQWEQDYRANVGNHKNKGTVSTTLLLKDVSYITVSNLEITNDDADVYDPIDTWKWTDTPDSDGTKLDRSASRMDRTGVAGIAENGATMSNVTLDNLYIHDVDGNIYNKHMANGGIYFMAHYPMENTSAETDVWLREHVSRFDHVTIRNSTVKDVDRWGIAVGYTAYLNYIDANYGDGSIDDALIAKYGSTNVRIENNYVKGAGGDAITLMYCDRPVIEHNVGDSVSKHINTQDYTQPGSYGGRVAAGIWPWRCKDPVFQYNEMYNNLNAEHGNGDGQAWDADYGDGTLYQYNYSYGNSFASLMICNWYAVNTTFRYNISQNDRQGVFDLPSNGPGNHIYNNTVYVDADSQVLTKRSNSQSLFENNIFINATNTKKTETWNRGSQNGGQTYDNNMYVNYANKPTSDANAIEADDVSAVLAGAGSAPTSALKSGAEHARTGEKAAFDGYRPVAGSKAINAGKVVSDLNDYAVENDFLGNAVKGRPDLGAVEAA
Chain A Sequence
GTTYYVSSAHGDDANAGTSENAPWKSLTKVNDIASDLGPGDSVLLEYGSEFNDQYLHIKDTAGNADAPITISAYGDADEGKPVIASNGVKGSQWEQDYRANVGNHKNKGTVSTTLLLKDVSYITVSNLEITNDDADVYDPIDTWKWTDTPDSDGTKLDRSASRMDRTGVAGIAENGATMSNVTLDNLYIHDVDGNIYNKHMANGGIYFMAHYPMENTSAETDVWLREHVSRFDHVTIRNSTVKDVDRWGIAVGYTAYLNYIDANYGDGSIDDALIAKYGSTNVRIENNYVKGAGGDAITLMYCDRPVIEHNVGDSVSKHINTQDYTQPGSYGGRVAAGIWPWRCKDPVFQYNEMYNNLNAEHGNGDGQAWDADYGDGTLYQYNYSYGNSFASLMICNWYAVNTTFRYNISQNDRQGVFDLPSNGPGNHIYNNTVYVDADSQVLTKRSNSQSLFENNIFINATNTKKTETWNRGSQNGGQTYDNNMYVNYANKPTSDANAIEADDVSAVLAGAGSAPTSALKSGAEHARTGEKAAFDGYRPVAGSKAINAGKVVSDLNDYAVENDFLGNAVKGRPDLGAVEAA
Chain A Sequence
SGTTYYVSSAHGDDANAGTSENAPWKSLTKVNDIASDLGPGDSVLLEYGSEFNDQYLHIKDTAGNADAPITISAYGDADEGKPVIASNGVKGSQWEQDYRANVGNHKNKGTVSTTLLLKDVSYITVSNLEITNDDADVYDPIDTWKWTDTPDSDGTKLDRSASRMDRTGVAGIAENGATMSNVTLDNLYIHDVDGNIYNKHMANGGIYFMAHYPMENTSAETDVWLREHVSRFDHVTIRNSTVKDVDRWGIAVGYTAYLNYIDANYGDGSIDDALIAKYGSTNVRIENNYVKGAGGDAITLMYCDRPVIEHNVGDSVSKHINTQDYTQPGSYGGRVAAGIWPWRCKDPVFQYNEMYNNLNAEHGNGDGQAWDADYGDGTLYQYNYSYGNSFASLMICNWYAVNTTFRYNISQNDRQGVFDLPSNGPGNHIYNNTVYVDADSQVLTKRSNSQSLFENNIFINATNTKKTETWNRGSQNGGQTYDNNMYVNYANKPTSDANAIEADDVSAVLAGAGSAPTSALKSGAEHARTGEKAAFDGYRPVAGSKAINAGKVVSDLNDYAVENDFLGNAVKGRPDLGAVEAA
sequence length 582,582,582,583
structure length 582,582,582,583
publication title Molecular Insight into Evolution of Symbiosis between Breast-Fed Infants and a Member of the Human Gut Microbiome Bifidobacterium longum
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lacto-N-biosidase
source organism Bifidobacterium longum subsp. longum
pdb deposition date2016-08-07
LinkProt deposition date2017-04-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
...loading similar chains, please wait...

...loading similar chains in PDB, please wait...


 
#similar chains in the LinkProt database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
#similar chains, but unlinked
...loading similar chains, please wait...
#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...

LinkProt | Interdisciplinary Laboratory of Biological Systems Modelling